BIOA01H3 Lecture Notes - Lecture 32: Single-Nucleotide Polymorphism, Molecular Clock, Paraphyly

• School: UTSC
• Department: Biological Sciences
• Course: BIOA01H3
• Professor: varies

Document Summary

Biologist like to (cid:272)lassif(cid:455) thi(cid:374)gs, it is do(cid:374)e th(cid:396)ough a hie(cid:396)a(cid:396)(cid:272)hi(cid:272)al (cid:272)lassii(cid:272)aio(cid:374). The fu(cid:396)the(cid:396) (cid:449)e go do(cid:449)(cid:374) the (cid:373)o(cid:396)e i(cid:374)(cid:272)lusi(cid:448)e to g(cid:396)oups. Mo(cid:374)oph(cid:455)lei(cid:272): all the o(cid:396)ga(cid:374)is(cid:373) i(cid:374) that g(cid:396)oup (cid:272)ould (cid:271)e t(cid:396)a(cid:272)ed (cid:271)a(cid:272)k to a (cid:272)o(cid:373)(cid:373)o(cid:374) a(cid:374)(cid:272)esto(cid:396): the th(cid:396)ee do(cid:373)ai(cid:374)s a(cid:396)e (cid:373)o(cid:374)oph(cid:455)lei(cid:272). Pa(cid:396)aph(cid:455)lei(cid:272): all sha(cid:396)e a (cid:272)o(cid:373)(cid:373)o(cid:374) a(cid:374)(cid:272)esto(cid:396), (cid:271)ut (cid:449)e a(cid:396)e(cid:374)"t looki(cid:374)g at e(cid:448)e(cid:396)(cid:455)thi(cid:374)g: eg. All the (cid:396)epiles a(cid:396)e (cid:373)o(cid:374)oph(cid:455)lei(cid:272), (cid:271)ut (cid:271)i(cid:396)ds a(cid:396)e i(cid:374) that g(cid:396)oup that (cid:373)ake it pa(cid:396)aph(cid:455)lei(cid:272). The (cid:271)(cid:396)a(cid:374)(cid:272)h le(cid:374)gth (cid:272)a(cid:374) (cid:271)e i(cid:373)po(cid:396)ta(cid:374)t, the(cid:455) (cid:272)a(cid:374) tell us i(cid:373)e si(cid:374)(cid:272)e di(cid:448)e(cid:396)ge(cid:374)(cid:272)e o(cid:396) the a(cid:373)ou(cid:374)t of di(cid:448)e(cid:396)ge(cid:374)(cid:272)e. Whe(cid:374) (cid:449)e sta(cid:396)t (cid:271)uildi(cid:374)g a ph(cid:455)loge(cid:374)(cid:455), (cid:449)e sta(cid:396)t (cid:449)ith a(cid:374) u(cid:374)(cid:396)ooted t(cid:396)ee. If (cid:449)e a(cid:396)e i(cid:374)te(cid:396)ested a(cid:271)out the e(cid:448)oluio(cid:374)a(cid:396)(cid:455) histo(cid:396)(cid:455) of a (cid:373)a(cid:373)(cid:373)als, the outg(cid:396)oup (cid:449)ould (cid:271)e so(cid:373)ethi(cid:374)g that is (cid:374)ot a (cid:373)a(cid:373)(cid:373)al. This (cid:449)ould tell us (cid:449)hat the a(cid:374)(cid:272)est(cid:396)al state is i(cid:374) te(cid:396)(cid:373)s of the (cid:272)ha(cid:396)a(cid:272)te(cid:396) (cid:449)e a(cid:396)e i(cid:374)te(cid:396)ested i(cid:374). The (cid:271)est outg(cid:396)oups a(cid:396)e the o(cid:374)es that a(cid:396)e (cid:396)elai(cid:448)el(cid:455) si(cid:373)ila(cid:396), (cid:271)ut (cid:374)ot the sa(cid:373)e.